Novo istraživanje za pacijente s kolorektalnim karcinomom

Caris Life Sciences® predstavlja nalaze koji pružaju dublje razumijevanje da je tumorska ekspresija gena povezana s opsegom izloženosti lijekovima, stratificirana prema statusu p53, povezana s kliničkim ishodima na uobičajenim kemoterapijskim režimima koji se koriste za liječenje metastatskog kolorektalnog karcinoma (CRC). Ovi rezultati bit će predstavljeni na godišnjem sastanku Američkog udruženja za istraživanje raka (AACR) 2022. koji se održava od 8. do 13. travnja 2022. u New Orleansu, Louisiana.

Istraživanje s posterom pod naslovom "Prognostički i prediktivni lijekovi inducirani genski potpisi za pacijente s kolorektalnim karcinomom personalizirani na temelju statusa p53 i liječenja FOLFOX-om, 5-FU, oksaliplatinom ili irinotekanom" (Sažetak #1231), vodio je Wafik El-Deiry , MD, Ph.D., FACP, ravnatelj Legorreta centra za rak Sveučilišta Brown, pomoćnik dekana na Medicinskom fakultetu Warren Alpert, član Carisovog Precision Oncology Alliance (POA). Carisova POA rastuća je mreža vodećih centara za rak diljem svijeta koji surađuju kako bi unaprijedili preciznu onkologiju i istraživanja temeljena na biomarkerima. Ovaj rad u New Orleansu predstavlja Lindsey Carlsen, studentica diplomskog studija patobiologije u laboratoriju EL-DEIRY u Brownu.

Cilj ovog istraživanja bio je identificirati prediktivne biomarkere za kemoterapije korištene u CRC. Studija je koristila CRC stanične linije za identifikaciju različito izraženih gena nakon liječenja 5-fluorouracilom, irinotekanom ili oksaliplatinom i stratificirala potpise na temelju statusa p53. Iz ovih in vitro studija, istraživači su zatim ispitali mogu li ti geni i genski potpisi predvidjeti ishode CRC pacijenata nakon kemoterapije (FOLFOX, 5-fluorouracil, irinotekan ili oksaliplatin). 2,983 divljeg tipa i 6,229 uzoraka pacijenata s gubitkom funkcije p53 CRC analizirano je sekvenciranjem sljedeće generacije DNA/RNA u Caris Life Sciences. Ishodi preživljavanja u stvarnom svijetu izvedeni su iz podataka o štetama u osiguranju i Kaplan-Meierovim procjenama. I prognostička i neprognostička ekspresija gena imala je značajan učinak na ishode preživljavanja nakon specifičnih tretmana lijekovima.

“Ova studija nam pomaže razumjeti važnost koju genski potpisi imaju u demonstriranju poboljšane prediktivne sposobnosti u usporedbi s pojedinačnim transkriptima”, rekao je El-Deiry. “Premošćujući temeljna i klinička istraživanja, ovo nam istraživanje omogućuje bolje razumijevanje koje terapije će vjerojatnije koristiti pacijentima s CRC-om.” Studija je pokazala da tumorska ekspresija gena povezana s izloženošću lijekovima može predvidjeti ishode nakon kemoterapije:

• Visoki EGR1 i FOS mRNA neovisno predviđaju odgovor na FOLFOX u bolesnika s tumorima divljeg tipa p53.

• Niska mRNA CCNB1 korelira s dobrom prognozom bolesnika s CRC-om s tumorima koji sadrže mutacije gubitka funkcije TP53.

• Niska ekspresija BTG2 predviđa bolju prognozu u bolesnika s MSI-High TP53 mutiranim tumorima.

• Genski potpisi mogu pokazati poboljšanu sposobnost predviđanja u usporedbi s pojedinačnim učincima transkripta.

“Caris je usredotočen na biomarkere koji mogu predvidjeti odgovor pacijenata na najnovije terapije, ali i na isprobane i prave kemoterapije poput FOLFOX-a”, rekao je W. Michael Korn, dr. med., glavni medicinski direktor u Carisu. "Uzbuđeni smo što vidimo translacijsku istraživačku sposobnost osnaženu ogromnim multi-omskim podacima i analitičkim alatima koje je Caris razvio i nastavlja napredovati."

Carisovo sveobuhvatno molekularno profiliranje procjenjuje cijeli egzom (DNA), cijeli transkriptom (RNA) i ekspresiju proteina, pružajući neusporediv resurs i idealan put naprijed za provođenje translacijskog istraživanja kako bi se ubrzalo otkriće za otkrivanje, dijagnozu, praćenje, odabir terapije i razvoj lijekova poboljšati ljudsko stanje.

Caris će predstaviti dodatne podatke iz studija koje pokazuju ključnu ulogu precizne medicine i molekularnog profiliranja u liječenju raka. Sve prezentacije bit će dostupne online putem Carisove web stranice od 8. travnja 2022.

Dodatne prezentacije otkrivaju utjecaj sveobuhvatnog molekularnog profiliranja i potencijalne kliničke djelotvornosti

• Sveobuhvatna karakterizacija promjena FGF/FGFR kod invazivnih karcinoma dojke (Sažetak #5793) FGFR signalizacija je središnja za proliferaciju stanica raka, migraciju, angiogenezu i preživljavanje; Promjene FGFR-a postale su klinički djelotvorne u sve većem broju vrsta raka. Ova studija procijenila je učestalost i karakterizaciju brojnih promjena FGF/FGFR u preko 12,000 XNUMX invazivnih karcinoma dojke i naglasila ogromnu heterogenost promjena FGF/FGFR u različitim histološkim i molekularnim podtipovima, kao i različitim metastatskim mjestima raka dojke. Nadalje, povezanost promjena FGFR-a i otpornosti na terapije prikazana je u velikoj kliničkoj bazi podataka s podudarnim molekularnim rezultatima.

• Genomske i imunološke karakteristike EGFR podtipova u karcinomu pluća nemalih stanica (NSCLC) (Sažetak #4119) Dok su EGFR mutantni NSCLC tumori općenito otporni na PD-1/PD-L1 inhibitore, mala podskupina pacijenata može imati trajne odgovore . EGFR-mutantni tumori pokazuju značajnu molekularnu heterogenost, međutim, postoji nedostatak jasnoće u vezi s genomskim i imunološkim profilima podtipova mutacije EGFR-a, a daljnje pojašnjavanje ovoga može pomoći u identificiranju pacijenata koji će vjerojatno odgovoriti na terapije temeljene na imunološkom sustavu. Koristeći multi-omske molekularne podatke dobivene sekvenciranjem DNA i RNA sljedeće generacije na velikoj skupini NSCLC tumora, ova studija potvrđuje smanjenu imunogenost povezanu s većinom podtipova EGFR mutacija koje se očituju biomarkerima uključujući PD-L1, TMB i CD8+ T infiltracija stanica; i otkriva rijetke EGFR mutacije povezane s povoljnim imunološkim profilom koje mogu sugerirati odgovor na imunološku terapiju.